История завода начинается с 1933 года, когда механическим мастерским порта был присвоен статус завода и они были переданы в подчинение управлению нефтеналивного флота «Совтанкер».В 1934 году по приказу «Наркомвода» началось строительство завода.
В 1936 году заводу было присвоено имя Ф.Э.Дзержинского. В годы Великой Отечественной войны завод наряду с работой по ремонту флота изготавливал военную продукцию (авиабомбы, мины). В конце 1942 года, в связи с невозможностью постановки судов на ремонт из-за непрекращающихся бомбёжек и разрушений промышленных объектов, завод был эвакуирован в порты Батуми и Поти.
К 1951 году завод был восстановлен и выполнял объём судоремонта в полтора раза больший, чем перед войной. С 1952 года по 1957 год была проведена первая крупная реконструкция завода: с этого времени началась специализация завода на ремонте серийных танкеров типа «Казбек».
С 1957 по 1965 год на заводе был освоен выпуск разнообразной номенклатуры сменно-запасных частей для судовых двигателей отечественных и иностранных марок.
C 1967 по 1978 год была проведена широкомасштабная реконструкция, в результате которой завод стал судоремонтным предприятием морского флота России.
В 1992 году завод при приватизации был преобразован в акционерное общество «Туапсинский судоремонтный завод».
В 1990-е годы, когда наметилась тенденция перехода коммерческих судов под иностранные флаги. Завод фактически остался без заказов, и остро стал вопрос о его переориентации. Так от ремонта «малого» танкерного флота типа «СПЛИТ» и «КАЗБЕК» предприятие перешло к совершенно новому для него ремонту кораблей Военно-морского флота и береговой охраны ФСБ России.
Первые отголоски кризиса начались еще в 2007 году, когда секретариат Совета по морской деятельности Краснодарского края направил в администрацию региона предложения по развитию судоремонта и судостроения. Объем услуг по судоремонту предприятиями Краснодарского края сократился с 666 млн руб. в 2002 г. до 192 млн в 2006г.
Весной 2008 года останавливается литейный цех ТСРЗ в связи со стапроцентным износом оборудования, а также несовершенной системы вентиляции, цех также не был оборудован системой очистки позволяющей улавливать вредные вещества http://www.kp.ru/daily/24120/342995/. В этом же году на сайте КПРФ появилась статья о скором закрытии завода http://kprf.ru/actions/57830.html .
К 2009 году положение на предприятии продолжало ухудшаться. Если в предшествующие годы более 50% дохода от судоремонта приходилось на ремонт кораблей и судов ЧФ, то в 2009 году объем дохода сократился до 30% http://disclosure.1prime.ru/portal/default.aspx?emId=2322002888.
Серьезной угрозой для дальнейшего функционирования судоремонтного производства является критическое состояние единственного судоподъемного сооружения завода плавучего дока № 12. Износ корпуса дока достигает 80%. Буксировка дока на ремонт небезопасна. Стоимость ремонта сопоставима со стоимостью нового дока аналогичной грузоподъемности. Кризисные явления на мировом рынке также привели к сокращению спроса и снижению дохода от деятельности и машиностроительного производства. Убыток в 2009 году составил более 19 миллионов рублей.
Советом директоров ОАО «ТСРЗ» от 28.12.2010г. (протокол № 147) принято решение о передаче в аренду имущественного комплекса машиностроения – недвижимого имущества и оборудования – ООО «Туапсинский машиностроительный завод» сроком на 11,5 месяцев. Передача осуществлена 01.02.2011г.
В декабре 2010 года завод начал увольнение работников, сократив 26 штатных единиц, а с марта 2011 года планирует уволить еще 320 человек.
http://www.kommersant.ru/doc-rss/1572462
Также имеет место значительный износ технологического оборудования, вызывающий частые прости в его работе.
В 2011 году ОАО «ТСРЗ» остановил производство судоремонтных работ и приступил к консервации производственных площадей, а также высвобождении сотрудников.
Машиностроительное производство ОАО «ТСРЗ» являлось фактически единственным производством на постсоветском пространстве, выпускающем цилиндровые втулки судовых ДВС диаметром более 400мм.
По состоянию на 2012 год 78% выручки составли услуги по предоставлению стоянки судов, а также аренда имущества и услуги портового крана ПК-46. Производственная деятельность полностью прекращена http://disclosure.1prime.ru/portal/default.aspx?emId=2322002888.